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數字切片掃描儀怎么選?

發布時間:2025-02-15

訪問量:8309

數字切片掃描儀怎么選?


2024年5月,Nature發布了一篇重磅論文,微軟和華盛頓大學等機構共同推出了全球首個全切片數字病理AI模型GigaPath ,具備十億像素級別圖像的處理和理解能力,相當于能理解40X 物鏡下掃描的數字切片。目前Prov-GigaPath的模型和代碼已經開源,部分科研機構已經開始自己制作數字切片文件,來進一步訓練GigaPath用于各種生物醫學研究。那么數字切片掃描儀怎么選呢?


一、數字切片



數字切片①

數字切片是用高分辨率物鏡將玻璃切片掃描、拼接形成的圖像文件,每張數字切片都有數億像素,40X高分辨物鏡掃描的數字切片像素更可接近10億,信息量非常大。



數字切片解決方案:數字切片掃描儀MDS4

完整的數字切片解決方案可以分四大功能板塊:

1、掃描:使用數字切片掃描儀捕獲圖像數據。

2、儲存:將圖像數據儲存為數字切片文件并歸檔管理。

3、處理:提供數字切片圖像旋轉、顏色調整等處理功能。

4、閱片:瀏覽數字切片文件,以及與其他人分享切片文件。

可見,整個數字切片解決方案核心圍繞的是數字切片文件。


二、為什么要做數字切片?

相比傳統的玻璃樣品切片,數字切片有哪些優勢呢?



使用數字切片訓練AI識別不同細胞②


首先是AI模型訓練。AI模型輔助能大大提升工作效率,比如在癌癥研究引入AI,可幫助加速識別癌癥標記物和腫瘤分型等流程,但AI需要大量的數據訓練才能高效、準確,核心數據就是數字切片文件。



數字切片方便信息共享和合作

其次是信息共享及增強合作。玻璃玻片難以分享,MDS4的數字切片文件可以通過網絡分享,讓突破地域限制的分享成為可能,網絡會議、跨學科合作研究都會受益。



稀有樣品掃成數字切片很有價值(類戈謝細胞)

第三是保護珍貴樣品。制作精良的稀有樣品千金難求,有些珍貴樣品在老師手上也就僅此一片,但玻片畢竟是易碎的玻璃,最怕不小心損壞。利用MDS4的數字切片文件,可以將樣品的最佳狀態和豐富信息記錄下來。


三、怎么選數字切片掃描儀器



箱式數字切片掃描儀僅適合少數量大的用戶

箱式數字切片掃描儀高價且功能單一,不適合大部分用戶。從大批量處理能力來說,箱式的數字切片掃描儀搭配工作站電腦無疑是冠軍方案。但這種方案的成本很高,除了少數大醫院和實驗室有足夠的量來保證能夠回本,其他大部分小醫療機構和科研單位根本回不了本,因為他們平均每周的掃描量可能十個手指就能數完。



普通顯微鏡做數字切片效果不理想

普通顯微鏡手動掃描拼接效果不理想,不適合嚴肅應用。手動掃描拼接只需數字攝像頭和軟件搭配即可實現,成本夠低,但效果較差,比如玻片中間有空白就會掃描不下去,又比如樣品不平整導致局部失焦模糊,還有光照不均勻、物鏡平場性不佳導致拼接痕跡明顯。最后就算掃描很順利,掃出來的幾億像素文件也會讓瀏覽切片變成災難。



數字切片掃描儀MDS4有更高投入產出比

明美數字切片掃描儀MDS4是更符合大部分單位需要的數字切片掃描儀器。MDS4既是研究級熒光顯微鏡,又是數字切片掃描儀,一機兩用,有媲美箱式掃描儀的掃描速度和精度,也有專業的儲存格式和閱片軟件,投入產出比更高。



MDS4可作為電動研究級熒光顯微鏡使用

明美數字切片掃描儀MDS4以一機兩用為設計理念,適合大部份單位的投入產出目標。

1、基于研究級熒光顯微鏡,可用于FISH熒光原位雜交和免疫熒光觀察研究。

2、創新雙分光相機接口,同時滿足高幀率掃描和高分辨率單視野成像。

3、可作為升級套件安裝到客戶現有的BX43/BX53等顯微鏡,更低投入實現掃描功能,不影響原有顯微鏡功能。



性能媲美箱式數字切片掃描儀

明美數字切片掃描儀MDS4基于研究級熒光顯微鏡設計,可以實現媲美箱式掃描儀的掃描速度和精度。

1、MDS4采用高精度XYZ三軸電動平臺,閉環分辨率達0.1μm,掃描平穩精準低噪音,搭配峰值幀率100fps以上的掃描相機,全片掃描速度可低至40秒完成。

2、MDS4支持自動對焦掃描,遇到不平整區域可自動進行疊加景深,使整個玻片所有視野都細節清晰。

3、MDS4軟件采用了硬件加速進行無縫拼接,因此無需工作站電腦也能快速出圖并儲存成數字切片文件。



專業的配套軟件

明美數字切片掃描儀MDS4配套Slide Scan掃描軟件和Slide Viewer閱片軟件,專業的儲存格式和閱片軟件帶來良好的用戶體驗。

1、MDS4軟件采用先進的SRP格式數據,占用空間比常見圖片格式更低,同時保留數億像素豐富信息。

2、MDS4閱片軟件提供豐富的數字切片管理功能和處理功能,自動拍攝玻片標簽和數字切片一一對應,提供色彩調整等常用處理功能。

3、MDS4軟件廣泛使用硬件加速技術,閱片縮放和拖動瀏覽都十分順暢。


大部分單位每周的切片掃描量不到10片,一臺能實現數字切片掃描功能的研究級顯微鏡,是更符合這些單位投入產出目標的產品,明美數字切片掃描儀MDS4就是針對這些客戶設計的產品,如果您有需要,歡迎致電明美了解咨詢。


應用文獻:

①Konstantinos Zormpas-Petridis1, Rosa Noguera, et al. SuperHistopath:A Deep Learning Pipeline for Mapping Tumor Heterogeneity on Low-Resolution Whole-Slide Digital Histopathology Images,Front. Oncol., 20 January 2021,Sec. Cancer Imaging and Image-directed Interventions,Volume 10 - 2020 | https://doi.org/10.3389/fonc.2020.586292


②Yannick Van Herck1, Asier Antoranz,et al. Multiplexed Immunohistochemistry and Digital Pathology as the Foundation for Next-Generation Pathology in Melanoma: Methodological Comparison and Future Clinical Applications, Front. Oncol., 29 March 2021, Sec. Skin Cancer, Volume 11 - 2021 | https://doi.org/10.3389/fonc.2021.636681


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